2023年11月25日,由上海市生物信息学会、上海市遗传学会、上海人类学学会联合举办的“生物信息技术和标准化在临床数据分析中应用”学术沙龙在上海长三角国家创新中心报告厅成功举办。本次学术沙龙旨在展示生物信息技术和标准化在临床数据分析领域的前沿研究及实际应用,为生物信息学、遗传学和标准化领域的专家和科研人员提供一个交流和沟通的平台。

图 1 应贝丽副秘书长致辞
学术沙龙由上海国际人类表型组研究院承办,并受到了上海市科学技术协会和上海长三角技术创新研究院的大力支持。活动邀请了临床医学数据分析、脑科学大数据分析、生命科学人工智能、生物数字融合标准化等领域的5位专家作学术报告,分享了生物信息技术和生命科学领域标准化在临床数据分析应用中最前沿的研究进展和创新成果。来自生物信息学、遗传学等领域的高校、科研院所、企业代表近80人参加了本次沙龙,并受到了广大学生及企业代表的一致好评。
生物信息学已经由新兴学科成为一门成熟的尖端交叉学科,是现代生命科学及卫生健康、转化医学不可或缺的组成部分,在基因组学、转录组学、表型组学等高通量组学以及脑科学、神经科学等研究中居于主导地位。标准化作为质量基础设施的重要环节,在技术产生及发展、人类健康挑战等方面起到了越来越重要的作用,并成为数字化转型的根基。生物信息技术和标准化工作的结合在生命健康、应用生物学大数据挖掘、人工智能、合成生物学、疾病机制探讨、新药研发等生物及医学前沿领域逐渐展现出举足轻重的作用。

图 2 俞章盛教授做报告
在本次学术沙龙活动中,上海交通大学生命学院/医学院俞章盛教授做了题为“Harnessing TME depicted by histological images to improve the cancer prognosis through a deep learning system”的学术报告,介绍了通过大数据分析和人工智能技术将癌症患者病理图片转化为空间转录表达相关的信息,刻画肿瘤微环境,并构建肿瘤患者愈后生存分析的预测模型,从而提高肿瘤患者愈后生存分析预测的准确性。

图 3 黄涛研究员做报告
中国科学院上海营养与健康研究所黄涛研究员做了题为“生物医学大数据的智能分析与应用”的学术报告,介绍了人工智能共性技术在医学临床大数据分析、蛋白质标志和蛋白质设计等前沿研究中的技术应用,以及对生命科学科研范式转变的推动作用,并介绍了生物医药大数据的智能分析系统、平台和应用工具。

图 4 孙怡迪研究员做报告
中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心孙怡迪研究员做了题为“多组学大数据在脑科学研究中的应用”的学术报告,介绍了脑神经元细胞空间转录组大数据在不同脑区细胞类型的空间组成及关联性分析,从而实现描述神经元细胞类型的空间分布和功能,并介绍了目前脑神经多组学大数据分析存在的问题和未来研究方向。

图 5 丁国徽研究员做报告
上海国际人类表型组研究院丁国徽研究员做了题为“生命系统和生物工程标准化研究”的学术报告,介绍了国内外生物数字融合标准化研究进展,以及人类表型组计划和生物医学大数据基础设施建设中的标准化工作,阐述了生命科学基础科学研究和标准化融合发展促进生物医药数据共享和流通的重要作用。

图 6 郭云峰高工做报告
上海国际人类表型组研究院郭云峰高工做了题为“生命科学标准化方法和途径研究” 的学术报告,介绍了生命科学领域标准化与科技创新互动发展的国家政策,并通过大量翔实的案例深入浅出的讲解了标准化基本概念以及科学试验方法及临床数据集类型标准制定的基本方法和途径。

图 7 参观上海长三角国家创新中心成果展
活动期间,上海长三角技术创新研究院组织与会人员参观了上海长三角国家创新中心成果展,详细的介绍了党中央国务院、上海市政府等对上海长三角国家创新中心的政策支持,国创中心的发展历程、对科技创新和产业高质量的支撑引领作用及卓著成果,从而推动实施创新驱动发展战略、强化国家战略科技力量建设以及长三角一体化发展等国家重大发展战略。

图 8 参会人员合影
本次学术沙龙的举办增进了从事生物信息技术、临床应用数据应用及标准化相关研究的学者和产业界人士对现有生物医学大数据平台、数据资源体系和高性能存储计算环境以及生物信息学、脑科学、生物医学标准化工作的了解,有利于促进大数据平台和标准化工作在生物大数据产生、质控、管理、分析和数据共享的应用,从而推动我国生物医药和临床数据分析的高质量创新发展。
